水利建設基金應計入“稅金及附加”科目進行核算。水利建設基金是專項用于水利建設的政府性基金，由中央水利建設基金和地方水利建設基金組成。中央水利建設基金主要用于關系國民經濟和社會發展全局的大江大河重點工程的維護和建設，地方水利建設基金主要用于城市防洪及中小河流、湖泊的治理、維護和建設。
當企業計提水利建設基金時，會計分錄如下：
借：稅金及附加——水利建設基金
貸：應交稅費——應交水利建設基金
當企業繳納水利建設基金時，會計分錄如下：
借：應交稅費——應交水利建設基金
貸：銀行存款
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