稅務局查企業偷稅漏稅的方式具體包括：
1、消費者向當地稅務機關舉報；
2、被稽查納稅人上下游的企業連帶查出問題；
3、系統比對，例如通過涉稅指標分析等方法比對。企業存在異常指標值會被列入風險企業名單，長期零申報或企業所得稅長期報虧損的企業是稅務局重點檢查對象。
稅務稽查指的是由稅務稽查部門依法組織實施的對納稅人、扣繳義務人履行納稅義務、扣繳義務的情況進行全面地、綜合檢查的行為。稅務稽查主要對象是對涉及偷、逃、抗、騙稅的大案要案進行檢查。
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