影響回購協議利率的因素主要包括以下四個方面：
1、抵押證券的質量。質押債券的信用等級會影響回購利率的高低，信用等級越高，流動性越好，回購利率越低。
2、回購期限的長短。回購期限與回購協議利率呈正比關系，期限越長，回購利率越高。
3、交割的條件。若采用實物交割的方式，回購利率會降低；若采用其他交割方式，利率就會相對提高。
4、同業拆借利率和貼現利率。兩者的變動水平和趨勢會影響回購利率的高低。若回購利率在同業拆借利率和貼現利率之上，資金將投向回購協議市場，由此導致回購協議利率下降。
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