企業所得稅年度匯算清繳的檢查事項包括從業人數、資產總額、是否屬于國家限制或禁止行業，以及營業收入、營業成本、利潤總額、不征稅收入、免稅收入、彌補以前年度虧損等內容。
其中從業人數、資產總額、是否屬于國家限制或禁止行業三個項目的填寫能夠影響到納稅人是否可以享受小型微利企業的稅收優惠。申報表上的營業收入、營業成本納稅人應當根據自身實際情況填寫本年準確的累計數額。而不征稅收入、免稅收入、彌補以前年度虧損等項目數據的確認，納稅人可以通過查閱《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》等法律法規進行了解。同時納稅人還應當注意附表的填寫，包括《職工薪酬及納稅調整明細表》、《企業所得稅彌補虧損明細表》等。
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