重慶地區個人獨資企業針對員工工資薪金個稅的計算方法為：應納稅額=（累計預扣預繳應納稅所得額×預扣率-速算扣除數）-累計減免稅額-累計已預扣預繳稅額。累計預扣預繳應納稅所得額的計算方法為：累計預扣預繳應納稅所得額=累計收入-累計免稅收入-累計減除費用-累計專項扣除-累計專項附加扣除-累計依法確定的其他扣除。
個人獨資企業針對生產經營所得個稅的計征可以分為查賬征收和核定征收，查賬征收方式下的計算公式為：經營所得個稅應納稅額=（全年收入總額-成本、費用以及損失）×適用稅率-速算扣除數。核定征收（核定應稅所得率）方式下的計算公式為：經營所得個稅應納稅額=（收入總額×應稅所得率）×適用稅率。
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