注冊會計師和會計碩士的區別在于：
1、考試科目的不同
注冊會計師分為專業階段和綜合階段的考試，專業階段考試的科目包括《會計》、《審計》、《財務成本管理》、《公司戰略與風險管理》、《經濟法》、《稅法》；綜合階段考試的科目為《職業能力綜合測試（試卷一、試卷二）》。會計碩士分為會計專業碩士和會計學碩士，會計專業碩士的初試科目為《管理類綜合能力》、《外國語》；會計學碩士的初試科目為《思想政治理論》、《外國語》、《業務課一》、《業務課二》。會計專業碩士與會計學碩士的復試考試都由院校自主命題。
2、人才培養方向的不同
注冊會計師考試更傾向于對審計人才的培養，會計碩士主要培養面向會計職業的，以更好地適應社會主義市場經濟發展和經濟全球化需要的應用型高層次會計人才。
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