旅行社可以開電子或紙質的增值稅普通發票、電子或紙質的增值稅專用發票，根據旅行社所選擇的計稅方法為基準，旅行社所開具的發票也可以分為一般計稅方式的發票或差額征稅方式的發票。相比起一般計稅方式，差額征稅方式是營改增后稅務機關為處理無法通過增值稅進項稅額抵扣的存在重復征收風險項目的一項措施，該方式所開具的發票會在備注欄中顯示差額征稅的字樣和金額。同時對于符合條件的旅行社所發生的差額部分收入要求只能開具增值稅普通發票，而對于旅行社剩余部分的收入則允許開具增值稅專用發票。
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