1、企業為員工代繳個人所得稅時，會計分錄為：
借：應交稅費——應交個人所得稅
貸：銀行存款
2、企業為員工代扣個人所得稅時，會計分錄為：
借：應付職工薪酬——應付職工工資
貸：應交稅費——應交個人所得稅
銀行存款
企業為員工進行個人所得稅的代扣代繳，并通過“應交稅費——應交個人所得稅”科目進行個稅核算。個人所得稅是調整征稅機關與自然人之間在個人所得稅的征納與管理過程中所發生的社會關系的法律規范的總稱。我國個人所得稅的納稅義務人是在中國境內居住有所得的人，以及不在中國境內居住而從中國境內取得所得的個人，包括中國國內公民和在華取得所得的外籍人員和港、澳、臺同胞。
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