電算化審計與傳統手工審計的區別有：
1、審計線索不同。會計電算化的資料不再是傳統的憑證等文字記錄和資料，而是磁盤和磁帶，肉眼所見的線索減少，很難用人工實現各種總賬與分賬之間的相互換算。
2、審計內容不同。會計電算化信息系統大大減少了計算或過賬錯誤，但會計電算化系統可能被舞弊程序或者黑客利用，且不容易察覺，有比較大的系統安全性問題。
3、技術方法不同。電子計算機不能逐筆打印記錄供工作人員閱讀，一般過一個階段打印一次，并且平時只能憑借機器閱讀，很難做到在多筆記錄中對照查看。
4、技術手段不同。會計電算化信息系統審計人員由手工操作向電子計算機轉變，把電子計算機當作一種提高審計質量和效率的有利工具來使用。
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