會計信息系統評價的方法比較多，大致可以分為兩類，分別是基于主觀標準的評價和基于客觀標準的評價。
基于主觀標準的評價是一種“主觀”的評價，評價標準是人的主觀滿意度。用戶意識中的經驗現象與其他客觀標準一樣重要，完全可以用項目相關人員的主觀滿意度作為項目的成敗判斷標準。基于主觀標準的評價方法有專家打分法、滿意度調查表、效用評價法等。
基于客觀標準的評價是一種“客觀”評價，其結果一般不受相關人員主觀意愿的影響，一般用一系列量化的指標綜合反映被評價的信息系統，并采用一定的數學模型對這些量化指標進行運算，形成最終的評價結果，常見的平衡記分卡、模糊綜合評價方法和人工神經網絡方法都屬于客觀標準評價法。
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