會計信息化審計的主要內容及方法有：
1、審計線索的追蹤審查。交易的無紙化讓審計人員很難追蹤審計線索，因此需要在系統內建立日志和追蹤文件，注意備份；
2、審查會計信息系統的安全性。電子形式的會計信息容易丟失損壞，因此要定期做安全測試；
3、審查會計信息系統的內部控制。由于會計系統的復雜性，內控范圍也擴大了，因此要注意審查備份和權限制度等；
4、審查會計信息系統的應用程序。注意程序處理過程是否符合有關法規，注意考核程序對錯誤的檢驗和控制情況；
5、充分利用網絡進行輔助審計。比如利用視頻會議系統進行取證等。
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