稽核評稅的指導思想是促進納稅人提高依法納稅的水平，促進改善稅收征管措施，達到強化稅收征管、增強稅收監控的管理工作的目的。
主管稅務機關根據納稅人報送的增值稅納稅申報資料以及日常掌握的各種稅收征管信息，依據國家相關法律法規和政策的規定，運用一定的技術手段和方法，對納稅人的增值稅納稅申報的合法性、真實性、準確性和完整性進行綜合評定，以發現、處理納稅申報中的偏差。
稽核評稅是稅收征管工作的重要組成部分，是對稅收征管質量進行監督檢查的主要環節，主管稅務機關應設專職崗位負責稽核評稅工作。
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