運費發票稅額計算公式為：運費發票稅額=含稅票面金額÷(1+適用稅率)×適用稅率。
其中：
1、企業為一般納稅人時：
運費發票稅額=含稅票面金額÷(1+9%)×9%；
2、企業為小規模納稅人時：
運費發票稅額=含稅票面金額÷(1+3%)×3%。
一般納稅人提供交通運輸服務的，其增值稅稅率為9%;企業為小規模納稅人的，則按3%征收率計算增值稅;增值稅交通運輸業的范圍包括：陸路運輸服務、水路運輸服務、航空運輸服務、管道運輸服務。
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