小規模企業企業所得稅的計算可以分為查賬征收方式下的計算和核定征收方式下的計算。
在查賬征收方式下企業所得稅的計算方法為：應納稅額=應納稅所得額×適用稅率-減免稅額-抵免稅額。應納稅所得額的計算公式為：應納稅所得額=收入總額-不征稅收入-免稅收入-各項扣除金額-允許彌補的以前年度虧損。
在核定征收（核定應稅所得率）方式下企業所得稅的計算方法為：應納稅額=收入總額×核定的應稅所得率。
若小規模企業滿足小型微利企業的確認條件時，則可以在應納稅額計算的過程中享有相應的優惠稅率和應納稅所得額的減免。對小型微利企業年應納稅所得額不超過100萬元的部分，減按12.5%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅；對小型微利企業年應納稅所得額超過100萬元但不超過300萬元的部分，減按25%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅。
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