公司非公開發行股票，根據規定，新增的股本和資本公積（發行溢價部分）按照“營業資金賬簿”，適用稅率萬分之五，減半征收即萬分之二點五繳納印花稅，計稅金額應該是實際募集的資金金額。
根據《國家稅務總局關于資金賬簿印花稅問題的通知》（國稅發〔1994〕25號）第一條規定，生產經營單位執行“兩則”后，其“記載資金的賬簿”的印花稅計稅依據改為“實收資本”與“資本公積”兩項的合計金額。第二條規定，企業執行“兩則”啟用新賬簿后，其“實收資本”和“資本公積”兩項的合計金額大于原已貼花資金的，就增加的部分補貼印花。
又根據《財政部稅務總局關于對營業賬簿減免印花稅的通知》（財稅〔2018〕50號），自2018年5月1日起，對按萬分之五稅率貼花的資金賬簿減半征收印花稅，對按件貼花五元的其他賬簿免征印花稅。
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