海關進口增值稅專用繳款書是增值稅抵扣憑證之一，實行“先比對后抵扣”的管理辦法，增值稅一般納稅人進口貨物取得海關繳款書，需要申報稅務機關稽核比對相符后，繳款書上的增值稅額才可以抵扣。

　　海關進口增值稅專用繳款書如何抵扣？

　　具體流程如下：

　　一、先下載“通用稅務數(shù)據(jù)采集軟件”

　　使用現(xiàn)行“通用稅務數(shù)據(jù)采集軟件”采集我們要抵扣的海關進口增值稅專用繳款書，

　　二、數(shù)據(jù)采集

　　1.打開下載的軟件系統(tǒng)，點擊“海關完稅憑證抵扣清單”→“新增報表”;

　　2.輸入所屬區(qū)間。

　　3.點擊“新增”，錄入需采集的海關繳款書信息。包括專用繳款書號碼、進口口岸代碼、進口口岸名稱、填發(fā)日期、稅款金額這五項，一定要準確無誤，信息一致，否則會稽核不通過。

　　4.錄入完畢并檢查無誤后，將數(shù)據(jù)導出。

　　三、上傳數(shù)據(jù)

　　導出數(shù)據(jù)之后，登陸當?shù)厥须娮佣悇站郑M入“我要查詢--稽核結果查詢—海關完稅專用繳款書”窗口，把數(shù)據(jù)上傳至主管稅務機關進行稽核比對，每月可報送多次。注意在上傳時選擇后綴為JK的文件。

　　上傳完畢后還要在“海關專用繳款書數(shù)據(jù)上傳狀態(tài)查詢”模塊查看數(shù)據(jù)是否上傳成功。

　　如果顯示信息“接收成功”就說明上傳完成，然后等待稽核結果就可以了。

　　稅務機關會按照每個月為一個稽核期，對海關繳款書數(shù)據(jù)進行稽核比對，。

　　四、下載確認

　　稅務機關會于每月納稅申報期內(nèi)提供上月《海關進口增值稅專用繳款書稽核結果通知書》。我們可以查詢稽核比對結果信息，每月只能確認一次，一旦確認，不可更改。

　　五、確認《海關進口增值稅專用繳款書稽核結果通知書》后，就可以進行“海關專用繳款書稽核結果通知書打印”或“海關專用繳款書稽核結果通知書明細查詢”

　　六、填寫增值稅納稅申報表

　　分為兩種情況，一種是已申請稽核但尚未取得稽核相符結果的，需要填列《增值稅納稅申報表》(一般納稅人適用)附表二“待抵扣進項稅額”中的“海關進口增值稅專用繳款書”欄，將海關繳款書上的進項稅額填入即可。

　　另一種情況是稽核結果通知書中稽核結果為相符的，將海關繳款書份數(shù)、稅額填寫在《增值稅納稅申報表》附表二第5欄。